二氧化碳培養箱自動殺菌裝置能使箱內溫度達到90℃從而殺死污染微生物，當它與HEPA系統結合使用就能夠極大的減少污染。這些裝置對于細胞培養來說是*，但選擇何種清潔裝置呢？當然功能越多越好的較適用，但是價格也會隨之上升。如果經費有限，只能選擇一個價格較便宜的，這時就應該配合使用一些消毒劑和除菌劑，經常進行消毒滅菌，也能達到貴儀器的效果，只是比較麻煩一點而已。總之，無論二氧化碳培養箱選擇何種裝置，都要時刻注意保持培養箱的清潔，經常清理箱體，這樣才能增加儀器的使用壽命，并使實驗順利進行，保證結果的可靠性。
l、二氧化碳培養箱 未注水前不能打開電源開關，否則會損壞加熱元件。盡量減少打開玻璃門的時間。鋼瓶壓力低于0.2MPa時應更換鋼瓶。
2、二氧化碳培養箱可以做高精度恒溫培養箱使用，這時須關閉CO2控制系統。因為CO2傳感器是在飽和濕度下校正的，因此加濕盤必須時刻裝有滅菌水。
3、搬運培養箱前必須排除箱體內的水。排水時，將橡膠管緊套在出水孔上，使管口低于儀器，輕輕吸一口，放下水管，水即虹吸流出。搬運二氧化碳培養箱前應拿出工作室內的擱板和加濕盤，防止碰撞損壞玻璃門。搬運培養箱時不能倒置，同時一定不要抬箱門，以免門變形。拆裝工作室內支架護罩，必須使用隨機扳手，不得過度用力。
4、培養箱運行數月后，水箱內的水因揮發可能減少，當低水位指示燈(WLow12)亮時應補充加水。先打開溢水管，用漏斗接橡膠管從注水孔補充加水使低水位指示燈熄滅，再計量補充加水(CP-ST200A加水1800ml，CP-ST100A加水1200ml)，然后堵塞溢水孔。
5、當顯示溫度超過置定溫度1℃時，超溫報警指示燈(OverTemp7)亮，并發出尖銳報警聲，這時應關閉電源30分鐘；若再打開電源(溫控)開關(Power20)仍然超溫，則應關閉電源并報維修人員。
6、如果二氧化碳培養箱長時間不用，關閉前必須清除工作室內水分，打開玻璃門通風24小時后再關閉。清潔二氧化碳培養箱工作室時，不要碰撞傳感器和攪拌電機風輪等部件。
